Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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