Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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