Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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