Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CYTH1Q15438 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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