Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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