Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms