Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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MKRN4PQ13434 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP000345.2-201ENST00000608615 1081 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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