Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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CDH17Q12864 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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CDH17Q12864 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH17Q12864 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CDH17Q12864 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CDH17Q12864 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CDH17Q12864 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH17Q12864 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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