Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms