Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms