Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms