Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms