Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR1P43307 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms