Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms