Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM23P36406 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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