Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms