Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRHP20396 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms