Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-EP13747 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-EP13747 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-EP13747 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-EP13747 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-EP13747 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-EP13747 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-EP13747 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms