Protein–RNA interactions for Protein: P08670

VIM, Vimentin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIMP08670 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VIMP08670 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VIMP08670 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIMP08670 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIMP08670 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIMP08670 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VIMP08670 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VIMP08670 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VIMP08670 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VIMP08670 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms