Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TO15178 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TO15178 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TO15178 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TO15178 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TO15178 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TO15178 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TO15178 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TO15178 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TO15178 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.3 ms