Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms