Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms