Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms