Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms