Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms