Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms