Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms