Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms