Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms