Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXQ1Q9C009 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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