Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms