Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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