Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms