Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms