Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms