Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms