Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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