Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STRADAQ7RTN6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms