Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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