Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms