Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms