Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms