Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCL15Q16663 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL15Q16663 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms