Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms