Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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