Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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