Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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