Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX1Q14549 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX1Q14549 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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