Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms