Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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